腐植酸及其制品有多种用途。在农业方面，与氮、磷、钾等元素结合制成的腐植酸类肥料（例如：用氨中和腐植酸可制成腐植酸铵肥料），具有肥料增效、改良土壤、刺激作物生长、改善农产品质量等功能；硝基腐植酸可用作水稻育秧调酸剂；腐植酸镁、腐植酸锌、腐植酸尿素铁分别在补充土壤缺镁、玉米缺锌、果树缺铁上有良好的效果；腐植酸和除草醚、莠去津等农药混用，可以提高药效、抑制残毒；腐植酸钠对治疗苹果树腐烂病有效。在畜牧业方面，腐植酸钠用于鹿茸止血，硝基腐植酸尿素络合物作牛饲料添加剂也有良好的效果。在工业方面，腐植酸钠用于陶瓷泥料调整；低压锅炉、机车锅炉防垢；腐植酸离子交换剂用于处理含重金属废水；磺化腐植酸钠用于水泥减水剂；腐植酸制品还用作石油钻井泥浆处理剂（见油田化学品）；提纯腐植酸用作铅蓄电池阴极膨胀剂。中国有上述多种产品，应用比较广泛。

1.因地制宜：对含硫高的土壤和锈水田，不宜施用生物菌肥，因为硫能杀死生物菌。对于翻浆的水田，一般不用撒施，用喷雾的方法效果更明显。2.因温制宜：施用菌肥的较好温度是25℃~37℃，低于5℃，高于45℃，施用效果较差。对高温、低温、干旱条件下的农作物田块不宜施用。同时还应掌握固氮菌适宜土壤的含水量是60%~70%。3.因混制宜：注意不应将菌肥与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥以及稻草灰混合用，因为这些药、肥很容易杀死生物菌。或者先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。还应防止与未腐熟的农家肥混肥。4.因量制宜：对于多年来施用化肥的田块，施用生物菌肥时不能大量减施化肥和有机肥，因此，其取代量应做到前三年分别取代30%、40%和60%，磷、钾肥只能补足，不能减少。5.因时制宜：生物菌肥不是快速肥，在作物的营养临界期和营养大量吸收期前7~10天施用，效果较佳。

腐植酸钾是一种有机钾肥，因为其中的腐植酸是一种生物活性制剂，可提高土壤速效钾含量，减少钾的损失和固定，增加作物对钾的吸收和利用率，也具有改良土壤、促进作物生长、提高作物抗逆能力、改善作物品质、保护农业生态环境等功能；它与尿素、磷肥、钾肥、微量元素等混合后，可制成多功能复混肥料；此外，腐植酸钾还可用作石油钻井液的处理剂，主要起防止井壁坍塌的作用。腐植酸及其制品有多种用途。在农业方面，与氮、磷、钾等元素结合制成的腐植酸类肥料（例如：用氨中和腐植酸可制成腐植酸铵肥料），具有肥料增效、改良土壤、刺激作物生长、改善农产品质量等功能；硝基腐植酸可用作水稻育秧调酸剂；腐植酸镁、腐植酸锌、腐植酸尿素铁分别在补充土壤缺镁、玉米缺锌、果树缺铁上有良好的效果；腐植酸和除草醚、莠去津等农药混用，可以提高药效、抑制残毒；腐植酸钠对治疗苹果树腐烂病有效。

（1）在肥水上的应用：腐植酸钠较早在水产上的应用就是源于其肥料的属性，但并不是养分的原因。近两年有人提出其可以补充水体碳源，如果从这个角度上来谈，是有一定道理的，因为腐植酸钠是腐植酸的钠盐，腐植酸是一类高分子有机弱酸，是植物残体腐解后形成的产物，主要由碳、氢、氧、氮等元素组成。（2）净化水质：因为腐植酸钠是一种比较稳定的具有芳香结构的天然大分子有机质，由稀疏的芳香环连结一起构成的一张断断续续的网，结构中有许多大小不一的空洞孔隙。由于其具有复杂的结构和多种功能团，因而具有很高的反应活性和较强的吸附性能。所以其在实际应用中可以达到净化水质的效果，但实际的反馈效果来看，粉状产品比片状产品来得要快些，主要的原因可能是粉状产品在水中的沉降速度比片状产品来得快有关。同时净化水质的效果可能还有一个方面，一是多孔结构为有益生物提供了良好的繁殖场所；二是腐植酸钠本身可以释放初生态氧，从而对某些细菌的生长有抑制作用。

微生物菌肥是一种新型肥料。它是针对目前大部分农田土壤中有机质含量低、肥力低、土壤微生物种类和数量减少、土壤自恢复能力减弱、土壤板结等特点，用现代生物工程生产的生物产品。是一种低炭、纯天然、无毒、无害、绿色环保的有机微生物菌剂，含有多达十余种活性有益微生物菌。其主要功能和作用是：有助于让土壤重返自然状态，具有提高土壤肥力，增加土壤中有益微生物数量及活性，改善土壤活化性状，调整土壤的PH值平衡，防止土壤板结；提高土壤保肥、保水能力，讯速繁殖形成有益菌群增强作物抗病能力，增加土壤中的有机质，阻止病原菌入侵，减少植物的病虫害生长。促进农作物生长，提高农作物产量，改善和还原农产品品质等功能。